Siguiendo el cuadro de clasificación adoptado por la Mesa de trabajo sobre organización de archivos municipales (1996), la documentación de un ayuntamiento se clasifica en cuatro grandes secciones, que responden a la función directiva y legislativa (Gobierno); a la proporción de medios para ejecutar las decisiones adoptadas (Administración); a la organización y distribución de funciones para desarrollar sus competencias (Servicios); y a la función económica que gestiona, fiscaliza y rinde las cuentas de la corporación (Hacienda). Y fuera de la documentación municipal pero custodiada en el archivo se clasifican bajo la sección de Archivos particulares, los documentos generados por otras instituciones y que por diversas razones han terminado depositados en el archivo municipal.
1. Gobierno1.01. Concejo/Ayuntamiento
1.02. Alcalde
1.03. Comisiones de Gobierno
1.04. Comisiones Informativas y Especiales
2. Administración
Servicios2.01. Secretaría
2.02. Registro General
2.03. Patrimonio
2.04. Personal
2.05. Servicios Jurídicos
2.06. Contratación
2.07. Archivo
3.01 Obras y Urbanismo
3.02 Servicios Agropecuarios e Industriales-Promoción Económica
Agricultura y Ganadería
3.03 Abastos y Consumo
Caza
Pesca
Industria
Turismo
Trabajo
Abastos
3.04 Transporte
Mercados
Mataderos
Pósito
3.05 Seguridad Ciudadana
Seguridad Ciudadana
3.06 Sanidad
Bomberos
Milicias Urbanas
Policía Local
Protección Civil
Sanidad
3.07 Beneficencia y Asistencia Social
Centros Sanitarios
Cementerio
Aguas y Alcantarillado
Limpieza Pública
Centros Sociales
3.08 Educación
Fundaciones
Centros Educativos
3.09 Cultura
Centros Culturales
3.10 Deporte
Centros Deportivos
3.11 Población
Empadronamiento
3.12 Quintas
Registro Civil
3.13 Elecciones
4. Hacienda
Archivos particulares4.01 Intervención Económica
4.02 Financiación y TributaciónFinanciación
Tributación4.03 Tesorería
Recaudación
Caja